Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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