Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rdh16f1E9Q9P8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms