Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn2r56E9Q4U5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms