Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ccdc71lE9Q4T4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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