Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms