Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms