Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms