Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms