Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms