Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30cD3YVI9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30cD3YVI9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms