Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp26c1B2RXA7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms