Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H60cB1B213 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms