Protein–RNA interactions for Protein: A6H666

Cox8c, Cytochrome c oxidase subunit 8C, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8cA6H666 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8cA6H666 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms