Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn1aA2APX8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms