Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myom3A2ABU4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myom3A2ABU4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms