Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GS82

A730009L09Rik, RIKEN cDNA A730009L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms