Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms