Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Nme3Q9WV85 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nme3Q9WV85 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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