Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnn1bQ9WU38 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms