Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms