Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcamQ9R069 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms