Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms