Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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