Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms