Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms