Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc4Q9QZD4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms