Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms