Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms