Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mid2Q9QUS6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms