Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms