Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3b2Q9JME5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ap3b2Q9JME5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms