Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms