Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms