Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Upk3aQ9JKX8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Upk3aQ9JKX8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Upk3aQ9JKX8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Upk3aQ9JKX8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms