Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod2Q9JKK7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms