Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms