Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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