Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp29Q9ES63 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp29Q9ES63 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms