Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cse1lQ9ERK4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms