Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms