Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf6Q9DBU5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf6Q9DBU5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf6Q9DBU5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf6Q9DBU5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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