Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Swt1Q9DBQ9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms