Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcg8Q9DBM0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcg8Q9DBM0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcg8Q9DBM0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcg8Q9DBM0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Abcg8Q9DBM0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Abcg8Q9DBM0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Abcg8Q9DBM0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Abcg8Q9DBM0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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