Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms