Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms