Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms