Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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