Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan13Q9D8C2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms