Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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