Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms